隧道设计涉及到多个专业领域的交叉，如结构工程、水文地质、隧道通风与照明等。在城市隧道工程设计项目中，市政行业（道路工程）专业设计甲级公司可能会面临一系列技术难题。这些问题可能包括地质复杂性、结构安全性、施工可行性以及环境影响等。
首先，针对地质复杂性，公司应组织专业地质勘探团队进行详细勘察，利用先进的地质探测技术，准确掌握隧道沿线地层分布、水文地质条件等信息。同时，结合地质资料，采用数值模拟等方法，预测隧道施工过程中可能遇到的地质风险，并制定相应的应对措施。
其次，在结构安全性方面，公司应依托专业团队，深入研究隧道结构受力特性，确保设计方案满足安全要求。此外，还应注重材料选择，采用高强度、耐久性好的建筑材料，提高隧道结构的整体性能。
再者，施工可行性是隧道工程设计中不可忽视的一环。公司应充分考虑施工条件、施工设备以及施工工期等因素，优化设计方案，降低施工难度，提高施工效率。
最后，环境影响评价也是隧道工程设计中不可或缺的一环。公司应按照国家相关法规，对隧道工程可能产生的环境影响进行评估，并采取相应的环保措施，确保工程建设与环境保护相协调。
综上所述，市政行业（道路工程）专业设计甲级公司在城市隧道工程设计项目中，应综合运用专业知识、技术手段和管理经验，有效解决技术难题，确保隧道工程设计的科学性、合理性和可行性。