对于已经过期的资质证书，通常情况下是不能直接进行延期申请的。一旦资质证书超过了有效期，企业需要按照重新申请的流程来获取新的资质证书。
具体来说：
- **在证书有效期内申请延期**：如果企业在资质证书的有效期内提前提交延期申请，并符合相关条件（如人员配备、业绩等），则可以办理延期手续。
- **证书过期后的处理方式**：如果资质证书已经过期，则无法再申请延期。此时，企业必须停止使用该过期证书，并且不能再以原有资质承接新项目。企业需要根据当前的资质标准重新申请资质，这可能涉及更复杂的程序和更高的要求，包括但不限于重新评估企业的资产状况、技术装备、专业技术人员配置以及过往业绩等。
因此，为了避免不必要的麻烦和经济损失，企业应当密切关注自身资质证书的有效期限，在到期前合理安排时间进行延期申请。如果确实错过了延期的时间点，那么就需要尽快启动重新申请的程序，并确保满足的资质要求。建议联系当地的建设主管部门或查阅相关政策文件，了解具体的重新申请流程和所需材料。