是的，乙级测绘资质单位需要通过ISO 9000系列质量管理体系认证。具体来说：
- **甲级测绘资质单位**应当通过ISO 9000系列质量保证体系认证。
- **乙级测绘资质单位**可以选择通过ISO 9000系列质量保证体系认证，或者通过省级测绘地理信息行政主管部门的考核。
这意味着对于乙级测绘资质单位而言，虽然不是强制性要求必须通过ISO 9000认证，但是这是一种被认可的方式，用来证明单位具有有效的质量管理体系。如果未选择ISO认证，则需要通过省级测绘地理信息行政主管部门的考核来确保其质量管理达到相应标准。
因此，为了提升企业的市场竞争力和规范化管理水平，很多乙级测绘资质单位会选择进行ISO 9000系列质量管理体系认证。这不仅有助于提高内部管理效率和服务质量，还能在对外合作时展示企业的专业性和可靠性。同时，获得ISO认证也有利于满足客户对服务质量的要求，并可能成为某些项目投标中的加分项。
