公路设计资质和市政道路设计资质是分开的，并不能直接合并申请。这两个资质分别由不同的行业管理部门（交通部门负责公路工程设计资质，住房和城乡建设部门负责市政工程设计资质）进行管理和审批。
但是，随着我国建设工程资质改革的推进，部分资质可能已经按照新的政策进行了整合或调整。例如，在2021年及之后的资质改革中，某些地区的市政与公路设计资质可能会有所融合或者出现了统一的标准要求，允许企业在一定条件下同时申请或增项多个相关专业的资质。
因此，对于的情况，请务必查询国家住房和城乡建设部、交通运输部以及地方行政主管部门发布的资质管理规定和相关政策通知，以了解当前是否可以合并申请乙级公路设计资质与其他相关资质，如市政道路设计资质。
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