生产有机肥的车间会产生废气，这部分废气主要是在发酵过程中产生的，气味非常难闻，生产有机肥的工厂一般都在工业区，或者离居民区都比较远，有很多企业都是选择直接外排，但是这会导致居民或者企业投诉，而且环保部门是不允许这样不经处理直接排放的，所以要通过一定得措施对废气进行净化处理，经过净化处理之后将气味消除掉，然后才能通过15米高空排放.
有机肥废气的主要成分是氨、硫化氢、甲烷等，如果直接排放到大气中，会造成周围大面积的恶臭。臭气处理主要用于洗涤剂喷淋塔，如果臭味浓度相对较高，也需要使用UV光解除臭装置，采用的废气处理措施就是：集中收集+喷淋净化+光催化除臭+高空排放。
集中收集是指在发酵区安装集风罩(俗称气体收集罩)和通风管道，在尾部离心风机的作用下将废气集中引入喷淋洗涤塔。
废气净化，是指在洗涤塔喷洗后，在喷雾层、雾层收集废气，如果臭味浓度高，为提高脱臭效果，通常在洗涤塔末端增设紫外光解除臭装置，净化废气，过滤净化后的废气达到排放标准。